وبهذا القرار الجمهوري انشطرت جامعة السلام من جامعة غرب كردفان وآلت إليها ثلاث كليات كانت تتبع أصلاً للجامعة الأم وهى :
- كلية الاقتصاد وتنمية المجتمع – بابنوسة تأسست في العام 1999م وخرجت أول دفعة للبكالوريوس في العام 2003م .
- كلية الموارد الطبيعية والدراسات البيئة – الفولة تأسست في العام 2000م وخرجت أول دفعة في العام 2005م
- كلية هندسة النفط والمياه – المجلد تأسست في العام 1998م و تم قبول الدفعة الأولى من الطلاب في العام 011م
معهد الدراسات الإضافية وتنمية المجتمع ـ بابنوسة و الفولة ـ بدأ القبول لهذا البرنامج في العام 2000م ببابنوسة والعام 2002م بالفولة و تخرجت أول دفعة للدبلوم التقني في بابنوسة في العام (2003م) و في الفولة في العام 2005م .